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更换发动机不去车管所变更手续的后果有：

1、对年检会有影响，如果发现会直接导致年检不合格；

2、更换发动机，需提前向车管所申请，审批通过后，方可更换，如无申请需要进行补救；

3、如果没有去车管所变更，在事故发生时，直接连理赔都没有了。

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更换发动机不去车管所变更手续，被查到就会被扣押车辆的。

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必须车管所变更手续，不然年检到期时，是不允许年检的，并且在路上被交警查到会导致被扣车，这些都是更换发动起不去车管所做变更手续的后果。