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车辆套牌违章的处理方法如下：

1、你问的可能是车子被套牌了，然后还发生了违章吧，如果是的话一旦发现，需要第一时间进行报案；

2、报案需要携带与车辆相关的证件：身份证、驾驶证、行驶证；

3、还要写一份涉嫌被套用机动车基本情况的书面报案材料，包括：车辆的违法时间、违法地点、违法行为，以及其他能够证明车辆涉嫌被套牌的证据材料，另外附上涉嫌被套牌车辆前部和后部等，可以显示车辆细部特征的外观照片。

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这个在收集好证据后，就可以向交管部门申诉了，可以选择车辆登记所在地的交管部门申诉，也可以去违章所在地进行申诉。

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交警部门表示，车主如果发现自己的车被套牌，可以在机动车登记地、违法行为发生地公安机关交通管理部门进行报案的。