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机动车灭失证明当然是要去车管所办理的：

1、机动车灭失的，车主应当向登记地车辆管理机构申请注销登记；

2、申请时填写《申请表》，提交机动车登记证、机动车行驶证、车主身份证明、机动车灭失证明；

3、资料齐全后就可以去办理注销登记了，这个还是比较简单的。

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机动车灭失证明要在登记地车辆管理处办理。因自然灾害造成车辆灭火的，由起火地政府出具因自然灾害造成灭火的证明。

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肯定是去当地的车管所开的，机动车所有人去办理的时候需要带上车辆登记证，行驶证还有车主的身份证就可以了。