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因为你是两证合一，所以按照目前的法规总共只有12分，扣分会同时记在小车证上：

1、使用摩托车驾驶证给小车扣分，属于与准驾车型不符的行为。驾驶与驾驶证准驾车型不符，一次性扣12分，并处二百元以上二千元以下罚款，可以并处15日以下拘留。因此，不可以用摩托车驾驶证驾驶小汽车，更不能给小汽车扣分；

2、《道路交通安全法》第九十九条第一款规定：未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的由公安交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处15日以下拘留；

3、《机动车驾驶证申请以及使用规定》明文规定，一个人只可以有一个驾照。同样你的摩托车驾驶证和机动车驾驶证两本证件放在一起也依然只有12分而已。也就是说摩托车驾驶证扣分会影响小车驾照。

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摩托车和小车驾驶证并在一起，无论是骑摩托车违法记分还是开小车违法记分，都是记驾驶人的分，没有扣小车的分或者扣摩托车的分这个概念。因为一个驾驶人不会有多本驾驶证只能有一本驾驶证，可以有多个准驾车型，驾驶人可以注销掉其中一个准驾车型，但是记分总分只有12分。

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因为驾驶证是并在一起的，包含了（摩托车和小汽车的准驾车型），所以没有摩托车驾照和小汽车驾照这个区分，统称为你的驾驶证，扣分的话是记在你的驾驶证上。