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乡道限速40抓拍开60处罚会扣3分：

1、机动车驾驶员有下列违章行为之一的，一次记3分不按规定超车或者让车的；违反交通信号指示的；

2、路口遇有交通堵塞，强行驶入的；驾驶未经检验或者检验不合格的车辆的；

3、驾驶转向器、制动器、灯光装置等机件不符合安全要求的车辆的；进入导向车道后，不按规定方向行驶的。

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限速40开60超速50%（计算公式：（60-40）÷40×100%=50%），扣12分，处二百元以上二千元以下罚款。根据《道路交通安全违法行为记分分值》第一条 机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记12分第九点 驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速20％以上或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速50％以上，以及驾驶其他机动车行驶超过规定时速50%以上的。