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摩托车报废后三年会自动注销。

及时办理注销手续：

按照相关规定，个人名下若有机动车（包括摩托车）应该报废但未办理注销手续，该当事人名下不能够办理新车注册登记，因此，没有资格参加小客车号牌摇号。

提供相关材料：

由机动车所有人自行申报机动车已灭失的书面陈述材料，材料中应详细记录机动车灭失的时间和地点，以及记载“本人陈述事实真实有效，并愿意承担相应法律责任及经济责任”等内容。经交警部门审核后即可办理注销登记。