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驾驶证实习期有12分可以扣，因为每一本驾驶证在一个记分周期内都有12分，不管是实习期还是非实习期都是12分。

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1、扣完分后果：

习期驾驶证如果被扣完12分就会注销实习期车型，其中如果是B2及以上驾驶证实习期内扣6分就要延长一年实习期，而延长期间要是再扣6分就会注销驾驶证。

2、公安部139号令：

（1）机动车驾驶人在实习期内发生道路交通安全违法行为被记满12分，则注销其实习的准驾车型驾驶资格。被注销的驾驶资格若不是最高准驾车型，还应当按照第七十八条第一款规定，注销其最高准驾车型驾驶资格。

（2）持有大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证的驾驶人在一年实习期内记6分以上但未达到12分，实习期限延长一年。在延长的实习期内再次记6分以上但未达到12分，注销其实习的准驾车型驾驶资格。