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高速停应急车道会扣分，驾驶机动车违反规定在高速公路、违法占用行驶或停车的处200元罚款，并记6分。

根据《道路交通安全违法行为记分分值》二、机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记6分：第八项驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶的。

机动车在高速公路行驶时，非紧急情况不得在应急车道行驶或者停车。所谓紧急情况有两种：一是机动车发生交通事故或者故障确需停车等待救援时，可以在应急车道内临时停放。二是应急车道供警车、消防车、救护车、工程救险车在执行紧急任务时使用。

非紧急情况下在高速公路应急车道上行驶的根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条：机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者20元以上200元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。