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超速被扣满12分的处理流程是这样的：

1. 领通知书：拿着交警开的《机动车驾驶人交通违法满分教育通知书》，带上身份证、驾照或者扣证凭证，去车管所登记，领教育通知书。

2. 去学习：拿着通知书到驾校报名参加满分学习和考试。

3. 考科目一：学完后拿科目一预约单，带着身份证和预约单按时去考理论。

4. 合格后消分：考试过了就在培训中心消分，然后去扣证机关拿回驾照。整个过程完事就能恢复驾驶资格了。