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闯红灯扣分在计分周期到了后，处理了违章缴纳完所处罚款，记分才会清零。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》:1、对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，处罚与记分同时执行。若机动车驾驶人一次有两个以上违法行为记分，应当分别计算，累加分值。2、机动车驾驶人对道路交通安全违法行为处罚不服，申请行政复议或者提起行政诉讼后，经依法裁决变更或者撤销原处罚决定，相应记分分值予以变更或者撤销。3、机动车驾驶人在一个记分周期内记分未达到12分，若所处罚款已经缴纳，记分予以清除。若有罚款未缴纳，记分转入下一记分周期。