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自动启停对于发动机是不会有伤害的，因为自动启停功能需要工作是有条件的，如果发动机不能达到最佳的状态，比如水温达不到的时候自动启停功能是不工作的。所以带有自动启停功能的汽车是在热启动的状态下发动汽车的，因此对于发动机不会有伤害。

工作原理：

当车子因拥堵或路口要停止行进，驾驶人员可以踩下制动踏板，此时，系统自动检测开启，发动机空转且无挂挡，防锁定系统的车轮转速传感器显示为零，电子电池传感器显示有充足的能量进行再次的启动，整个过程都处于D档状态。

自动启停的优点是：

1、发动机可以自动熄火，减少燃油消耗，降低排放；

2、在发动机熄火后电源能取代皮带轮对发动机冷却风扇及车内空调提供运转动力。