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车辆合格证是车辆管理所保管。

在车辆交付时车辆合格证与车辆一起交给车主。新车上牌时，车辆合格证原件需要由车管部门归档保存。

汽车注册、上牌、上路、保险、过户、注销都需要车辆合格证。合格证是汽车的另一个重要凭证，也是汽车上门的必备凭证。有合格证的汽车才能符合国家对机动车装备质量及相关标准的要求。没有合格证或者不能及时取得合格证的，其所属车辆为黑车，不允许上路行驶。

根据文中介绍每一辆汽车的合格证书都需要交给车管所保存，如果没有合格资格证的汽则属于黑户车辆。