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科目三补考费可以在交管12123交，通过在线的方式缴纳，不缴纳机动车科目三的补考费是无法考科目三考试，也可以在驾校或者是驾考中心来缴纳驾驶证科目三的补考费。

12123科目三补考费交费步骤：1、打开交管12123手机APP。

2、输入账号密码登录，未注册的则先点击注册，按要求填写相关信息，完成注册后再返回登录界面登录。

3、进入主页后，点击更多功能。

4、在驾驶证业务栏目中找到考试费缴纳选项。

5、进入缴费页面后，点击未交费栏目，选择对应的未缴费科目，按要求进行缴费即可。