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科目三考试只要安全员踩刹车直接扣100分。系统就会判断不合格。科目三考试，安全员不会平白无故踩学员刹车，只是学员操作不当，或者受到了外界的干扰，安全员为了保险起见才会踩刹车。

安全员踩刹车就是学员操作缺少安全意识，或者是出现了安全隐患，这两种情况都表明学员还不具备正常驾驶汽车的能力，所以安全员才会踩刹车。

安全员是坐在副驾驶上的，在安全员脚下有一个附加刹车装置，这个刹车装置连接了一个传感器，只要是安全员踩了刹车，这个传感器就会传递信息给系统，然后系统就会判断学员考试成绩不合格。

关于科目三考试的相关介绍：

科目三包括道路驾驶技能考试和安全文明驾驶常识考试，是机动车驾驶证考核的一部分，不同的准驾车型道路驾驶技能考试内容不同。