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机动车在普通公路上行驶超速50%以上的按照不同的车辆会扣6分或者9分，一般罚款200元。

根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第九条第二项规定：驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的一次记9分。第十条第三项规定：驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的一次记6分。

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条规定：机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。