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摩托车改短尾是不合法的。因为改短尾已经改变了摩托车的外观，与行车证照片已经不相符。未经交警车管部门许可的改装属于非法改装。

根据《中华人民共和国道路交通安全法》规定，任何单位或者个人不得有下列行为：

1、拼装机动车或者擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征；

2、改变机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代号；

3、伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志；

4、使用其他机动车的登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志。

未经公安交通管理部门允许，擅自改装机动车底盘、发动机、悬挂、变速系统、方向系统、车胎轮毂、车灯、车身颜色喷涂和外观结构，以及机动车的有关技术数据与国务院机动车产品主管部门公告数据不符的都属于改装行为。