奥迪A6L后备箱宽1040mm，高500mm，进深1130mm，容积为460L。虽然这样的数据在同级车型里面并不突出，后排座椅也不能放倒，但是A6L的后备箱格局十分规整。很显然，名字里的L是L在了轴距上，因此后备箱尺寸并没有改观。不过对于奥迪来说，这点并不足以一提。

奥迪A6L打开行李箱可以通过按遥控钥匙上的后备箱开启按钮，或者拉动驾驶员侧车门中的开锁按钮，行李箱随机就会解锁弹起。当然，也可以通过行李箱盖拉手上的开关打开。当车辆被上锁后，按遥控钥匙上的后备箱开启按钮可以单独给后备箱解锁，再次关上后备箱盖，那么它就会自动上锁。

看过很多电影都知道，很多黑社会都是开着奥迪去绑票。如果不幸被绑了也不要着急，贴心的奥迪早就预料的这一情况发生，于是在后备箱盖处设置了应急开锁。挑开后备箱盖锁出的盖子，找个东西查到圆形凹陷内，将开锁杠杆压向一旁，行李箱盖就开锁了。