大众新桑塔纳使用6速Tiptronic自动变速箱，是由日本爱信变速箱制造公司提供，这款变速箱最大特点是应用广泛、质量稳定、技术可靠、皮实耐用、换挡平顺、传动效率高，能完全满足了日常驾驶的需要。不过新桑塔纳的这款手自一体变速器的手动部分被阉割了，只留下了运动模式选择，尽管如此，这款变速器绝对算得上同级优秀产品了。

它除了具有自动变速箱的D、3、2挡位外，只要把排挡杆推入手动变速区域，即可以上下拨动完成进、退挡。此时驾驶员可以随意选择挡位，不受限于自动系统的自动挡位选择，为了避免错误换挡所造成的发动机损伤，Tiptronic系统即使在手动模式下操作，若发动机转速过高而驾驶员仍未换挡，电脑将适时介入执行换挡；相反，驾驶员在不适当的发动机转速下换挡，电脑也会立刻作出判断，避免对车造成损伤。