查询自编车牌号是否已经被注册需要进行预选机动车号牌操作，车主不能直接查询车牌号的注册情况。预选号牌业务包括两个阶段，基本信息录入阶段和预选号牌阶段。在预选号牌阶段，车主就可以验证自编车牌号码是否已经被注册，如果没有被注册可直接使用，如果已被注册则失去一次自编机会。

如果用户选择自编车牌号，则在交管12123软件进入自编选号操作页面。在自编选号操作页面中，号牌号码只允许通过界面中的虚拟键盘输入，针对号牌号码的每一位，会根据号池情况计算可用字符，只有可用的字符在虚拟键盘中才可以选择，其他均禁用不允许点击，不允许点击部分就是已被注册的。界面上会显示用户为当前车辆进行自编选号的剩余个数，最多可以同时输入的号牌号码数。

如果用户自编不到满意号牌，并且还拥有随机选号机会。用户已用完自编选号个数，但还拥有随机选号机会，系统将自动跳转至随机选号。如果用户已用完自编选号个数，也用完了随机选号机会，用户将无法通过互联网为该车辆预选号牌， 系统会提示用户前往车管所办理选号等新车注册登记业务。

随即选号系统会为用户随机选出10个可选号牌号码，这时随机号牌栏会显示倒计时“距失效XX秒”， 同时，用户为当前车辆进行随机选号的剩余次数将减少1次，倒计时结束，随机号牌栏的号码将失效。可以根据剩余随即选号次数，多次选择。

综上所述，查询车牌号是否已经被注册，必须在预选机动车号牌操作中得到验证。