本田飞度依然搭载了1.5升自然吸气发动机，并且全系只有这一种排量。不过与上代不同的是，该发动机应用到了本田的VTEC（可变气门正时和升程电子控制系统）技术以及双顶置凸轮轴结构（上代为单顶置凸轮）。通过改变凸轮轴的角度控制进气量，再配合缸内直喷技术，控制燃油喷射量。从而达到高效动力输出和低油耗的目的。数据方面，该发动机的最大功率为96kW，最大扭矩为155Nm。对比上代车型的数据，在最大功率和扭矩方面分别提升了16kW和10Nm。这样的数据表现完全不输于目前市面上一般1.8L发动机的动力表现。

传动方面，这次新飞度除了最低配手动车型外，其余全部标配CVT变速箱，完全替代了上代车型的5AT。这款变速箱还带有“S挡”运动模式和“L”低速模式，不过没有配手动模式。在加速的平顺性和油耗方面比5AT更加出色。