醉酒不起诉并不会留下案底。因为醉酒不起诉也就免于刑事处罚了，仅仅只有行政处罚，也就不会留下有案底。

需要注意，醉驾虽然可以不起诉，但是也不是所有的醉驾都能够免于起诉，只有经过检测血液中的酒精含量低于150mg/100ml的，并且不具有《关于危险驾驶（醉驾）犯罪案件不起诉参考标准》第五条规定情形的，可以适用相对免起诉。超过150mg/100ml则按醉驾从重处理情节判决。

醉驾不起诉了结案流程

一、宣布、寄送不起诉决定书：人民检察院决定不起诉的，应当将不起诉决定书公开宣布，并将不起诉决定书送至以下单位。

（1）被不起诉人和他的所在单位，被起诉人正在关押的，应当立即释放；

（2）如果是公安机关移送的案件，应送至公安机关；

（3）如果案件有被害人，应将不起诉决定书送至被害人。

二、接触扣押、冻结：人民检察作出不起诉的决定后，就意味着刑事诉讼的终止，公安机关应以口头或书面的形式解除犯罪嫌疑人财物的冻结。

三、移送有关主管机关：虽然醉驾不起诉，不会受到刑事处罚，但行政处罚是少不了的；不起诉后，人民检察院会将案件和不起诉决定书交给有关主管部门处理，给予犯罪人行政处罚、行政处分或没收其违法所得。