手动挡加油门时一顿一顿的可能是因为发动机转速和变速器的转速不匹配、进行系统故障或燃油系统故障所导致的。最常见的原因就是转速不匹配，这种情况一般是因为档位之间的齿比较大，然后油门和离合的配合不到位。

进气系统故障：发动机工作的过程中需要吸入新鲜空气，空气要经过空气滤芯和进气歧管才能进入发动机气缸内，当进气歧管出现破损漏气的时候，加油门的时候会使得吸入气缸内的空气忽然变多变少，就会导致气缸内的可燃混合气燃烧不充分，出现一顿一顿的现象。更换进气歧管即可解决。

燃油系统故障：燃油系统主要是由喷油嘴、燃油管道和燃油泵组成的，喷油嘴、燃油管道是最容易受到燃油质量的影响造成堵塞的，当出现堵塞之后，供油就会不顺畅，在踩油门时就会出现一顿一顿的感觉，燃油泵卡滞也会导致供油不顺畅。处理办法是清理油路和喷油嘴，并检修燃油泵，必要时更换。